Kolonda yerleşmiş kanserlerde hastalıklı bölgenin, emniyetli sınırlarla çıkarılması tedavinin ana ilkesidir. Ana hedef, ameliyat sonrasında geride gözle görülebilen tümörlü dokunun kalmamasıdır. Eğer hastalık çıkan kolon ya da transvers kolonun sağ yarısında ise kolonun sağ yarısı, inen kolon ya da transvers kolonun sol yarısında ise kolonu sol yarısı çıkarılır. Sigmoid kolonda yerleşen tümörler için sigmoid kolon, bir mikta inen kolon ve rektum ile birlikte çıkarılır. Hastalıklı doku çıkarıldıktan sonra, geride kalan bağırsak uçları birbirine dikilir. Nadiren, özel durumlarda geçici olarak bağırsağı dışarı torba içine almak gerekebilir (kolostomi). Tümörün kolon duvarındaki ilerleme derinliğine göre ve lenf düğümü metastazına göre evresi belirlenir, eğer tümör kolon duvarı dışına çıkmamışsa ve lenf düğümü metastazı yoksa genellikle cerrahi yeterli olur. Tümörün duvar dışına çıktığı ya da lenf düğümlerine metastaz yaptığı durumlarda cerrahi tedaviye ek olarak ilaç tedavisi (kemoterapi) de gerekecektir. Eğer uzak organlara metastaz varsa, bu metastazlarda da mümkün olduğu kadar hastalıklı alanı çıkarmak hedeflenir. Ameliyat sonrasında ilaç tedavisi, metastatik hastalıkta bir gerekliliktir. Eğer ameliyat öncesi değerlendirmede karaciğerdeki metastazların gereide hastalıklı doku kalmayacak şekilde çıkarılmamayacağı düşünülürse, ameliyat öncesi kemoterapi uygulanarak metastaz sayıları ve çapları azaltılmaya çalışılır ki, tümünü çıkarmak mümkün olsun. Kolondaki hastalığın komşu organları da etkilediği durumlarda, cerrahi sırasında bu organların da çıkarılması gerekebilir. Gereksiz organ çıkarılmasını engellemek amacı ile bu grup hastalarda da ameliyat öncesi kemoterapi uygulamaları ile hastalılklı alan küçültülmeye çalışılır. Işın tedavisinin (radyoterapi) özel durumlar dışında kolon kanseri tedavisinde yeri yoktur.